Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5H0

PCDHGA3, Protocadherin gamma-A3, humanhuman

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Length 932 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA3Q9Y5H0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCDHGA3Q9Y5H0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDHGA3Q9Y5H0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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