Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TRAPPC8Q9Y2L5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms