Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC53.51■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC53.51■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC53.51■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.5■■■■■ 6.16
NISCHQ9Y2I1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC53.5■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC53.5■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC53.49■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC53.49■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.49■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.49■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC53.48■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.47■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC53.47■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC53.47■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.46■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.46■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC53.45■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.45■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC53.44■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC53.44■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC53.44■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC53.44■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC53.44■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC53.44■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC53.44■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC53.44■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC53.44■■■■■ 6.15
NISCHQ9Y2I1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC53.44■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.44■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.44■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.44■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC53.43■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC53.42■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC53.42■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC53.42■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.42■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC53.42■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC53.42■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC53.41■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.41■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC53.4■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC53.4■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC53.4■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC53.39■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC53.38■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC53.38■■■■■ 6.14
NISCHQ9Y2I1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC53.37■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC53.37■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC53.37■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.37■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC53.37■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC53.37■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC53.36■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC53.36■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC53.36■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC53.36■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.35■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC53.35■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC53.35■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.34■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC53.34■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.34■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC53.33■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC53.33■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.33■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC53.33■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.32■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.32■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.32■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.32■■■■■ 6.13
NISCHQ9Y2I1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.31■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC53.31■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC53.31■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC53.31■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.31■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC53.31■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.31■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.31■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC53.3■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.29■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC53.29■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC53.29■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC53.29■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC53.29■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC53.28■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.28■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.27■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC53.27■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC53.27■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC53.27■■■■■ 6.12
NISCHQ9Y2I1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.27■■■■■ 6.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms