Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPC6Q9Y210 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRPC6Q9Y210 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms