Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APPL1Q9UKG1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms