Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GDAP2Q9NXN4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDAP2Q9NXN4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GDAP2Q9NXN4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms