Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOPCQ9HD26 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOPCQ9HD26 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GOPCQ9HD26 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GOPCQ9HD26 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GOPCQ9HD26 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOPCQ9HD26 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOPCQ9HD26 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOPCQ9HD26 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOPCQ9HD26 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms