Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BBS2Q9BXC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BBS2Q9BXC9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms