Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSEN34Q9BSV6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSEN34Q9BSV6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSEN34Q9BSV6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms