Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
MYD88Q99836 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYD88Q99836 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYD88Q99836 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYD88Q99836 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms