Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMOQ99835 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMOQ99835 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMOQ99835 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMOQ99835 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMOQ99835 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMOQ99835 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMOQ99835 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOQ99835 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOQ99835 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOQ99835 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOQ99835 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOQ99835 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOQ99835 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOQ99835 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMOQ99835 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMOQ99835 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMOQ99835 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMOQ99835 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMOQ99835 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMOQ99835 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMOQ99835 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMOQ99835 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMOQ99835 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOQ99835 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOQ99835 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOQ99835 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOQ99835 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOQ99835 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOQ99835 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMOQ99835 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMOQ99835 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMOQ99835 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMOQ99835 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMOQ99835 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMOQ99835 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMOQ99835 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMOQ99835 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMOQ99835 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMOQ99835 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMOQ99835 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMOQ99835 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMOQ99835 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMOQ99835 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMOQ99835 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMOQ99835 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMOQ99835 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMOQ99835 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMOQ99835 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMOQ99835 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMOQ99835 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMOQ99835 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMOQ99835 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMOQ99835 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMOQ99835 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMOQ99835 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMOQ99835 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMOQ99835 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMOQ99835 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMOQ99835 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMOQ99835 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMOQ99835 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMOQ99835 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMOQ99835 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMOQ99835 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMOQ99835 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMOQ99835 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMOQ99835 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMOQ99835 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMOQ99835 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMOQ99835 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMOQ99835 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMOQ99835 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMOQ99835 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMOQ99835 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMOQ99835 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMOQ99835 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMOQ99835 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMOQ99835 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMOQ99835 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMOQ99835 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMOQ99835 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMOQ99835 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMOQ99835 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMOQ99835 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMOQ99835 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMOQ99835 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMOQ99835 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMOQ99835 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMOQ99835 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMOQ99835 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SMOQ99835 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMOQ99835 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMOQ99835 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMOQ99835 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMOQ99835 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMOQ99835 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMOQ99835 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMOQ99835 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMOQ99835 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.9 ms