Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF560Q96MR9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF560Q96MR9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms