Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSANTD3Q96H12 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSANTD3Q96H12 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSANTD3Q96H12 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSANTD3Q96H12 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSANTD3Q96H12 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSANTD3Q96H12 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSANTD3Q96H12 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSANTD3Q96H12 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSANTD3Q96H12 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSANTD3Q96H12 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSANTD3Q96H12 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MSANTD3Q96H12 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MSANTD3Q96H12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSANTD3Q96H12 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms