Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SCMH1Q96GD3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCMH1Q96GD3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SCMH1Q96GD3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCMH1Q96GD3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCMH1Q96GD3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCMH1Q96GD3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCMH1Q96GD3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCMH1Q96GD3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCMH1Q96GD3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCMH1Q96GD3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCMH1Q96GD3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCMH1Q96GD3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCMH1Q96GD3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCMH1Q96GD3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms