Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA2

PATE1, Prostate and testis expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE1Q8WXA2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PATE1Q8WXA2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PATE1Q8WXA2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PATE1Q8WXA2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE1Q8WXA2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE1Q8WXA2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE1Q8WXA2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE1Q8WXA2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE1Q8WXA2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE1Q8WXA2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE1Q8WXA2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PATE1Q8WXA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms