Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC38A9Q8NBW4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A9Q8NBW4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms