Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNE4Q8N205 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNE4Q8N205 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNE4Q8N205 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNE4Q8N205 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNE4Q8N205 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNE4Q8N205 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNE4Q8N205 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNE4Q8N205 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYNE4Q8N205 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYNE4Q8N205 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYNE4Q8N205 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms