Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPAS3Q8IXF0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPAS3Q8IXF0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS3Q8IXF0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms