Protein–RNA interactions for Protein: Q86YT6

MIB1, E3 ubiquitin-protein ligase MIB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB1Q86YT6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIB1Q86YT6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIB1Q86YT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MIB1Q86YT6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIB1Q86YT6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIB1Q86YT6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIB1Q86YT6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms