Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTU1Q7Z7A3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTU1Q7Z7A3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTU1Q7Z7A3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTU1Q7Z7A3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTU1Q7Z7A3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTU1Q7Z7A3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTU1Q7Z7A3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTU1Q7Z7A3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTU1Q7Z7A3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTU1Q7Z7A3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTU1Q7Z7A3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTU1Q7Z7A3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTU1Q7Z7A3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms