Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPTNQ6XPR3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPTNQ6XPR3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPTNQ6XPR3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms