Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMOD2Q6P5Q4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LMOD2Q6P5Q4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms