Protein–RNA interactions for Protein: Q53TQ3

INO80D, INO80 complex subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80DQ53TQ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
INO80DQ53TQ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INO80DQ53TQ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INO80DQ53TQ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms