Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NRF1Q16656 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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