Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18Q15532 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18Q15532 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18Q15532 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18Q15532 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SS18Q15532 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18Q15532 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18Q15532 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18Q15532 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18Q15532 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18Q15532 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18Q15532 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18Q15532 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18Q15532 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SS18Q15532 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SS18Q15532 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18Q15532 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18Q15532 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18Q15532 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18Q15532 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18Q15532 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18Q15532 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18Q15532 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18Q15532 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SS18Q15532 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18Q15532 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18Q15532 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SS18Q15532 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SS18Q15532 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SS18Q15532 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18Q15532 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18Q15532 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SS18Q15532 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SS18Q15532 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18Q15532 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18Q15532 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18Q15532 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18Q15532 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18Q15532 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18Q15532 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SS18Q15532 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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SS18Q15532 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18Q15532 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18Q15532 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18Q15532 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18Q15532 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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SS18Q15532 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18Q15532 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18Q15532 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18Q15532 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18Q15532 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18Q15532 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SS18Q15532 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SS18Q15532 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SS18Q15532 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SS18Q15532 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SS18Q15532 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SS18Q15532 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SS18Q15532 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SS18Q15532 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SS18Q15532 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SS18Q15532 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SS18Q15532 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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