Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 ELOVL1-208ENST00000478481 564 ntTSL 213.23□□□□□ -0.293e-10■■■■■ 45.2
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SF3B4Q15427 TMA16-205ENST00000508652 1195 ntTSL 212.7□□□□□ -0.383e-10■■■■■ 45.2
SF3B4Q15427 BAIAP2-207ENST00000571530 581 ntTSL 412.33□□□□□ -0.446e-12■■■■■ 45.2
SF3B4Q15427 BAIAP2-214ENST00000573677 646 ntTSL 412.32□□□□□ -0.446e-12■■■■■ 45.2
SF3B4Q15427 ELOVL1-209ENST00000479439 646 ntTSL 512.23□□□□□ -0.453e-10■■■■■ 45.2
SF3B4Q15427 ELOVL1-214ENST00000497050 973 ntTSL 212.23□□□□□ -0.453e-10■■■■■ 45.2
SF3B4Q15427 ELOVL1-215ENST00000497569 830 ntTSL 312.07□□□□□ -0.483e-10■■■■■ 45.2
SF3B4Q15427 BAIAP2-218ENST00000574804 631 ntTSL 312.01□□□□□ -0.496e-12■■■■■ 45.2
SF3B4Q15427 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.493e-10■■■■■ 45.2
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SF3B4Q15427 ELOVL1-204ENST00000465321 726 ntTSL 511.8□□□□□ -0.523e-10■■■■■ 45.2
SF3B4Q15427 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.583e-10■■■■■ 45.2
SF3B4Q15427 ELOVL1-213ENST00000496932 779 ntTSL 311.39□□□□□ -0.593e-10■■■■■ 45.2
SF3B4Q15427 BAIAP2-215ENST00000573894 657 ntTSL 311.39□□□□□ -0.596e-12■■■■■ 45.2
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SF3B4Q15427 TMF1-201ENST00000398559 6849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.663e-10■■■■■ 45.2
SF3B4Q15427 PTPRF-208ENST00000437607 788 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.683e-10■■■■■ 45.2
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SF3B4Q15427 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.24e-11■■■■■ 45.1
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SF3B4Q15427 SYNJ1-202ENST00000382491 6958 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 45.1
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SF3B4Q15427 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 45.1
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SF3B4Q15427 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.253e-8■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 C21orf2-207ENST00000496321 1191 ntTSL 1 (best)16.31■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 45.1
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SF3B4Q15427 PIK3CD-207ENST00000543390 3503 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 PIK3CD-201ENST00000361110 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 SPPL2B-205ENST00000589515 1733 ntTSL 518.13■□□□□ 0.495e-22■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 SPPL2B-208ENST00000612623 495 ntTSL 515.27■□□□□ 0.045e-22■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.653e-9■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.353e-9■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 TNFAIP2-206ENST00000560428 773 ntTSL 516.43■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 TNFAIP2-205ENST00000559406 1799 ntTSL 514.4□□□□□ -0.13e-9■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 TNFAIP2-207ENST00000560562 1429 ntTSL 1 (best)12.63□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 TNFAIP2-208ENST00000560670 1334 ntTSL 211.9□□□□□ -0.53e-9■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 TNFAIP2-210ENST00000561156 590 ntTSL 410.58□□□□□ -0.723e-9■■■■■ 45.1
SF3B4Q15427 HNRNPH3-204ENST00000467249 566 ntTSL 27.36□□□□□ -1.233e-9■■■■■ 45.1
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SF3B4Q15427 KDM4A-205ENST00000485249 852 ntTSL 35.22□□□□□ -1.572e-8■■■■■ 45
SF3B4Q15427 DEAF1-208ENST00000527658 691 ntTSL 217.13■□□□□ 0.332e-12■■■■■ 45
SF3B4Q15427 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.481e-11■■■■■ 45
SF3B4Q15427 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.121e-11■■■■■ 45
SF3B4Q15427 C11orf98-203ENST00000532786 774 ntTSL 214.82□□□□□ -0.041e-11■■■■■ 45
SF3B4Q15427 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.141e-11■■■■■ 45
SF3B4Q15427 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.231e-11■■■■■ 45
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