RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479439.5

ELOVL1-209, Transcript of ELOVL fatty acid elongase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ELOVL1, Length 646 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOVL1-209ENST00000479439 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.75■■■□□ 2.83
ELOVL1-209ENST00000479439 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.98■■■□□ 2.23
ELOVL1-209ENST00000479439 ABCC9O60706 1549 aa28.23■■■□□ 2.11
ELOVL1-209ENST00000479439 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ELOVL1-209ENST00000479439 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.29■■□□□ 1.96
ELOVL1-209ENST00000479439 NACADO15069 1562 aa27.22■■□□□ 1.95
ELOVL1-209ENST00000479439 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.19■■□□□ 1.94
ELOVL1-209ENST00000479439 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.12■■□□□ 1.93
ELOVL1-209ENST00000479439 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.09■■□□□ 1.93
ELOVL1-209ENST00000479439 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.58■■□□□ 1.85
ELOVL1-209ENST00000479439 SCRIBQ14160 1630 aa26.51■■□□□ 1.83
ELOVL1-209ENST00000479439 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
ELOVL1-209ENST00000479439 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.41■■□□□ 1.82
ELOVL1-209ENST00000479439 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.1■■□□□ 1.77
ELOVL1-209ENST00000479439 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.76■■□□□ 1.71
ELOVL1-209ENST00000479439 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
ELOVL1-209ENST00000479439 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.53■■□□□ 1.68
ELOVL1-209ENST00000479439 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.52■■□□□ 1.68
ELOVL1-209ENST00000479439 SMARCA4P51532 1647 aa25.36■■□□□ 1.65
ELOVL1-209ENST00000479439 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
ELOVL1-209ENST00000479439 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.27■■□□□ 1.64
ELOVL1-209ENST00000479439 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.19■■□□□ 1.62
ELOVL1-209ENST00000479439 SMARCA2P51531 1590 aa25.14■■□□□ 1.61
ELOVL1-209ENST00000479439 NCAPD3P42695 1498 aa25.13■■□□□ 1.61
ELOVL1-209ENST00000479439 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.1■■□□□ 1.61
ELOVL1-209ENST00000479439 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ELOVL1-209ENST00000479439 HMGXB3Q12766 1538 aa25.01■■□□□ 1.59
ELOVL1-209ENST00000479439 WIZO95785 1651 aa24.99■■□□□ 1.59
ELOVL1-209ENST00000479439 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ELOVL1-209ENST00000479439 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ELOVL1-209ENST00000479439 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
ELOVL1-209ENST00000479439 NESP48681 1621 aa24.5■■□□□ 1.51
ELOVL1-209ENST00000479439 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.45■■□□□ 1.51
ELOVL1-209ENST00000479439 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.42■■□□□ 1.5
ELOVL1-209ENST00000479439 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.42■■□□□ 1.5
ELOVL1-209ENST00000479439 CFTRP13569 1480 aa24.32■■□□□ 1.48
ELOVL1-209ENST00000479439 ERCC6Q03468 1493 aa24.28■■□□□ 1.48
ELOVL1-209ENST00000479439 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.26■■□□□ 1.47
ELOVL1-209ENST00000479439 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.17■■□□□ 1.46
ELOVL1-209ENST00000479439 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.13■■□□□ 1.45
ELOVL1-209ENST00000479439 PRDM2Q13029 1718 aa24.08■■□□□ 1.45
ELOVL1-209ENST00000479439 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.07■■□□□ 1.44
ELOVL1-209ENST00000479439 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
ELOVL1-209ENST00000479439 MRC2Q9UBG0 1479 aa24■■□□□ 1.43
ELOVL1-209ENST00000479439 CUX2O14529 1486 aa23.94■■□□□ 1.42
ELOVL1-209ENST00000479439 WDR62O43379 1518 aa23.91■■□□□ 1.42
ELOVL1-209ENST00000479439 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
ELOVL1-209ENST00000479439 TOPBP1Q92547 1522 aa23.78■■□□□ 1.4
ELOVL1-209ENST00000479439 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.75■■□□□ 1.39
ELOVL1-209ENST00000479439 ABCC8Q09428 1581 aa23.74■■□□□ 1.39
ELOVL1-209ENST00000479439 CUX1P39880 1505 aa23.69■■□□□ 1.38
ELOVL1-209ENST00000479439 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ELOVL1-209ENST00000479439 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
ELOVL1-209ENST00000479439 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.56■■□□□ 1.36
ELOVL1-209ENST00000479439 IFT140Q96RY7 1462 aa23.56■■□□□ 1.36
ELOVL1-209ENST00000479439 SYNJ1O43426 1573 aa23.54■■□□□ 1.36
ELOVL1-209ENST00000479439 TOP2BQ02880 1626 aa23.51■■□□□ 1.35
ELOVL1-209ENST00000479439 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.5■■□□□ 1.35
ELOVL1-209ENST00000479439 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ELOVL1-209ENST00000479439 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.5■■□□□ 1.35
ELOVL1-209ENST00000479439 SOGA1O94964 1423 aa23.5■■□□□ 1.35
ELOVL1-209ENST00000479439 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ELOVL1-209ENST00000479439 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ELOVL1-209ENST00000479439 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
ELOVL1-209ENST00000479439 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
ELOVL1-209ENST00000479439 WDR97A6NE52 1622 aa23.34■■□□□ 1.33
ELOVL1-209ENST00000479439 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.33■■□□□ 1.33
ELOVL1-209ENST00000479439 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.22■■□□□ 1.31
ELOVL1-209ENST00000479439 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.22■■□□□ 1.31
ELOVL1-209ENST00000479439 GRIN2BQ13224 1484 aa23.18■■□□□ 1.3
ELOVL1-209ENST00000479439 TRIM41Q8WV44 630 aa23.18■■□□□ 1.3
ELOVL1-209ENST00000479439 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.15■■□□□ 1.3
ELOVL1-209ENST00000479439 PBRM1Q86U86 1689 aa23.13■■□□□ 1.29
ELOVL1-209ENST00000479439 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
ELOVL1-209ENST00000479439 KIF27Q86VH2 1401 aa23.08■■□□□ 1.28
ELOVL1-209ENST00000479439 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.06■■□□□ 1.28
ELOVL1-209ENST00000479439 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.05■■□□□ 1.28
ELOVL1-209ENST00000479439 FBLN2P98095 1184 aa23.03■■□□□ 1.28
ELOVL1-209ENST00000479439 SYNJ2O15056 1496 aa23.01■■□□□ 1.27
ELOVL1-209ENST00000479439 CHD1O14646 1710 aa23■■□□□ 1.27
ELOVL1-209ENST00000479439 OSCARQ8IYS5 282 aa23■■□□□ 1.27
ELOVL1-209ENST00000479439 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23■■□□□ 1.27
ELOVL1-209ENST00000479439 ADAMTS12P58397 1594 aa22.99■■□□□ 1.27
ELOVL1-209ENST00000479439 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ELOVL1-209ENST00000479439 IGF1RP08069 1367 aa22.99■■□□□ 1.27
ELOVL1-209ENST00000479439 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.98■■□□□ 1.27
ELOVL1-209ENST00000479439 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.96■■□□□ 1.27
ELOVL1-209ENST00000479439 GRIN2AQ12879 1464 aa22.89■■□□□ 1.25
ELOVL1-209ENST00000479439 CUL7Q14999 1698 aa22.87■■□□□ 1.25
ELOVL1-209ENST00000479439 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.84■■□□□ 1.25
ELOVL1-209ENST00000479439 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.79■■□□□ 1.24
ELOVL1-209ENST00000479439 NUP160Q12769 1436 aa22.79■■□□□ 1.24
ELOVL1-209ENST00000479439 CEP170Q5SW79 1584 aa22.78■■□□□ 1.24
ELOVL1-209ENST00000479439 EEA1Q15075 1411 aa22.75■■□□□ 1.23
ELOVL1-209ENST00000479439 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.73■■□□□ 1.23
ELOVL1-209ENST00000479439 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
ELOVL1-209ENST00000479439 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.72■■□□□ 1.23
ELOVL1-209ENST00000479439 PRXQ9BXM0 1461 aa22.71■■□□□ 1.23
ELOVL1-209ENST00000479439 ARHGEF11O15085 1522 aa22.63■■□□□ 1.21
ELOVL1-209ENST00000479439 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms