Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARAQ07869 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPARAQ07869 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPARAQ07869 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms