Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTDSPL2Q05D32 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTDSPL2Q05D32 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTDSPL2Q05D32 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms