Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PAX2Q02962 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms