Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RUNX1Q01196 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX1Q01196 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms