Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF3P78545 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ELF3P78545 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELF3P78545 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF3P78545 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF3P78545 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF3P78545 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF3P78545 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF3P78545 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF3P78545 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF3P78545 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELF3P78545 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF3P78545 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF3P78545 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF3P78545 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF3P78545 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF3P78545 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF3P78545 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF3P78545 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF3P78545 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELF3P78545 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ELF3P78545 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ELF3P78545 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF3P78545 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF3P78545 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF3P78545 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF3P78545 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF3P78545 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF3P78545 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF3P78545 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF3P78545 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF3P78545 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF3P78545 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF3P78545 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELF3P78545 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ELF3P78545 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF3P78545 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF3P78545 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF3P78545 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF3P78545 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF3P78545 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF3P78545 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF3P78545 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF3P78545 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ELF3P78545 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF3P78545 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF3P78545 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF3P78545 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF3P78545 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF3P78545 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF3P78545 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF3P78545 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF3P78545 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF3P78545 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF3P78545 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ELF3P78545 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF3P78545 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF3P78545 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF3P78545 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ELF3P78545 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ELF3P78545 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms