Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSNK2A1P68400 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CSNK2A1P68400 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2A1P68400 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms