Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOAP61586 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOAP61586 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOAP61586 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOAP61586 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOAP61586 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOAP61586 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOAP61586 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOAP61586 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOAP61586 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOAP61586 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOAP61586 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOAP61586 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOAP61586 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOAP61586 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOAP61586 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOAP61586 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOAP61586 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOAP61586 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOAP61586 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOAP61586 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOAP61586 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOAP61586 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOAP61586 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOAP61586 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOAP61586 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOAP61586 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOAP61586 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOAP61586 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOAP61586 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RHOAP61586 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOAP61586 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOAP61586 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOAP61586 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOAP61586 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOAP61586 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOAP61586 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOAP61586 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RHOAP61586 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RHOAP61586 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOAP61586 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOAP61586 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOAP61586 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOAP61586 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOAP61586 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOAP61586 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOAP61586 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOAP61586 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOAP61586 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOAP61586 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOAP61586 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOAP61586 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOAP61586 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOAP61586 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOAP61586 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOAP61586 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOAP61586 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOAP61586 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOAP61586 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOAP61586 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOAP61586 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOAP61586 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOAP61586 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOAP61586 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOAP61586 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOAP61586 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOAP61586 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOAP61586 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOAP61586 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOAP61586 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOAP61586 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOAP61586 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOAP61586 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOAP61586 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOAP61586 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOAP61586 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOAP61586 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOAP61586 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOAP61586 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOAP61586 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOAP61586 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOAP61586 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOAP61586 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOAP61586 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOAP61586 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOAP61586 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOAP61586 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOAP61586 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms