Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAD23AP54725 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms