Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAA2P54646 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA2P54646 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms