Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PHKA1P46020 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PHKA1P46020 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PHKA1P46020 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PHKA1P46020 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHKA1P46020 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHKA1P46020 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHKA1P46020 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHKA1P46020 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms