Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC1A2P43004 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms