Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KRT2P35908 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT2P35908 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT2P35908 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT2P35908 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT2P35908 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT2P35908 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT2P35908 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT2P35908 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT2P35908 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT2P35908 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT2P35908 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KRT2P35908 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT2P35908 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT2P35908 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT2P35908 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT2P35908 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT2P35908 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT2P35908 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT2P35908 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT2P35908 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT2P35908 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT2P35908 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT2P35908 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT2P35908 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT2P35908 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT2P35908 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT2P35908 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT2P35908 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT2P35908 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT2P35908 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT2P35908 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT2P35908 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT2P35908 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT2P35908 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT2P35908 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT2P35908 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT2P35908 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT2P35908 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT2P35908 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT2P35908 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT2P35908 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT2P35908 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT2P35908 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT2P35908 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT2P35908 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT2P35908 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT2P35908 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT2P35908 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT2P35908 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT2P35908 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT2P35908 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT2P35908 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KRT2P35908 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT2P35908 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT2P35908 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT2P35908 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT2P35908 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT2P35908 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT2P35908 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT2P35908 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT2P35908 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT2P35908 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT2P35908 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT2P35908 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT2P35908 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT2P35908 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT2P35908 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT2P35908 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT2P35908 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT2P35908 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT2P35908 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT2P35908 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT2P35908 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT2P35908 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT2P35908 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT2P35908 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT2P35908 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT2P35908 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT2P35908 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT2P35908 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT2P35908 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT2P35908 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT2P35908 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT2P35908 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT2P35908 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT2P35908 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT2P35908 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms