Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXC12P31275 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXC12P31275 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms