Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMB4P28070 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSMB4P28070 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSMB4P28070 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms