Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLNP26678 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLNP26678 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLNP26678 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLNP26678 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLNP26678 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLNP26678 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLNP26678 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLNP26678 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLNP26678 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLNP26678 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLNP26678 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLNP26678 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLNP26678 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PLNP26678 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLNP26678 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLNP26678 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLNP26678 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLNP26678 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLNP26678 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PLNP26678 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PLNP26678 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PLNP26678 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PLNP26678 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PLNP26678 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PLNP26678 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms