Protein–RNA interactions for Protein: P24468

NR2F2, COUP transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F2P24468 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR2F2P24468 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR2F2P24468 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms