Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1P21675 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1P21675 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1P21675 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1P21675 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1P21675 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAF1P21675 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1P21675 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1P21675 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1P21675 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1P21675 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1P21675 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1P21675 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1P21675 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1P21675 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1P21675 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1P21675 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1P21675 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAF1P21675 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1P21675 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1P21675 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1P21675 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1P21675 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1P21675 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1P21675 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1P21675 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1P21675 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1P21675 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1P21675 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAF1P21675 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1P21675 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1P21675 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1P21675 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1P21675 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1P21675 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1P21675 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAF1P21675 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF1P21675 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF1P21675 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAF1P21675 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TAF1P21675 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TAF1P21675 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1P21675 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1P21675 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1P21675 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1P21675 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1P21675 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAF1P21675 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1P21675 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1P21675 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1P21675 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1P21675 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1P21675 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1P21675 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1P21675 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1P21675 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1P21675 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1P21675 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1P21675 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAF1P21675 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1P21675 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1P21675 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1P21675 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAF1P21675 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1P21675 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1P21675 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1P21675 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAF1P21675 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1P21675 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1P21675 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1P21675 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAF1P21675 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1P21675 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1P21675 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1P21675 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1P21675 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1P21675 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1P21675 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1P21675 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1P21675 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1P21675 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1P21675 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1P21675 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAF1P21675 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TAF1P21675 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TAF1P21675 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1P21675 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1P21675 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1P21675 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1P21675 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1P21675 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1P21675 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1P21675 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAF1P21675 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1P21675 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1P21675 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1P21675 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1P21675 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAF1P21675 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAF1P21675 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms