Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN1P04843 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN1P04843 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN1P04843 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN1P04843 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN1P04843 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPN1P04843 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN1P04843 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN1P04843 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN1P04843 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN1P04843 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN1P04843 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN1P04843 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN1P04843 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN1P04843 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN1P04843 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN1P04843 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN1P04843 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPN1P04843 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN1P04843 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN1P04843 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN1P04843 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN1P04843 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPN1P04843 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPN1P04843 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPN1P04843 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPN1P04843 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPN1P04843 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPN1P04843 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPN1P04843 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPN1P04843 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN1P04843 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN1P04843 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN1P04843 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN1P04843 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN1P04843 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN1P04843 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN1P04843 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN1P04843 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN1P04843 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN1P04843 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN1P04843 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPN1P04843 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPN1P04843 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN1P04843 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN1P04843 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN1P04843 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN1P04843 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN1P04843 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN1P04843 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN1P04843 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN1P04843 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPN1P04843 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN1P04843 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN1P04843 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN1P04843 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN1P04843 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN1P04843 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN1P04843 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN1P04843 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN1P04843 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN1P04843 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN1P04843 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN1P04843 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPN1P04843 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPN1P04843 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPN1P04843 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPN1P04843 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPN1P04843 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPN1P04843 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPN1P04843 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPN1P04843 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPN1P04843 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPN1P04843 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPN1P04843 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPN1P04843 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPN1P04843 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPN1P04843 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPN1P04843 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPN1P04843 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPN1P04843 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPN1P04843 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPN1P04843 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPN1P04843 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPN1P04843 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPN1P04843 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms