Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LCA5LO95447 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LCA5LO95447 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LCA5LO95447 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms