Protein–RNA interactions for Protein: O76090

BEST1, Bestrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST1O76090 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST1O76090 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST1O76090 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST1O76090 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST1O76090 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST1O76090 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BEST1O76090 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BEST1O76090 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST1O76090 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST1O76090 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST1O76090 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST1O76090 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BEST1O76090 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST1O76090 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST1O76090 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST1O76090 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BEST1O76090 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST1O76090 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST1O76090 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST1O76090 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST1O76090 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST1O76090 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST1O76090 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST1O76090 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST1O76090 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST1O76090 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST1O76090 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST1O76090 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BEST1O76090 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST1O76090 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST1O76090 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST1O76090 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST1O76090 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST1O76090 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST1O76090 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST1O76090 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST1O76090 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST1O76090 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BEST1O76090 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST1O76090 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST1O76090 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST1O76090 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST1O76090 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST1O76090 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST1O76090 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST1O76090 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BEST1O76090 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST1O76090 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST1O76090 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST1O76090 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST1O76090 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST1O76090 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST1O76090 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST1O76090 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST1O76090 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST1O76090 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BEST1O76090 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEST1O76090 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEST1O76090 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BEST1O76090 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST1O76090 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST1O76090 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST1O76090 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST1O76090 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST1O76090 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST1O76090 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST1O76090 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST1O76090 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BEST1O76090 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST1O76090 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST1O76090 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST1O76090 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST1O76090 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST1O76090 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST1O76090 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST1O76090 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BEST1O76090 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST1O76090 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST1O76090 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST1O76090 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST1O76090 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BEST1O76090 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEST1O76090 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BEST1O76090 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEST1O76090 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEST1O76090 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEST1O76090 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEST1O76090 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BEST1O76090 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BEST1O76090 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BEST1O76090 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BEST1O76090 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BEST1O76090 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BEST1O76090 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BEST1O76090 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BEST1O76090 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BEST1O76090 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BEST1O76090 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BEST1O76090 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BEST1O76090 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms