Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZIC3O60481 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZIC3O60481 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZIC3O60481 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 379.2 ms