Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMAD6O43541 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD6O43541 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD6O43541 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.4 ms