Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC7A4O43246 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC7A4O43246 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC7A4O43246 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms